第一话：命运的相遇
故事的开端，住之江圭太是一个普通的高中生，与没有血缘关系的双胞胎姐姐住之江亚香和住之江理香住在一起。亚香是学生会会长，成绩优秀、性格温柔体贴；理香则是活泼开朗的运动型少女。两位姐姐都对圭太怀有超越姐弟的特殊感情，而圭太则在两人之间摇摆不定。
第一话中，圭太面临着高中入学考试的挑战，两位姐姐用各自的方式为他加油打气。亚香用温柔细腻的方式照顾圭太的起居，而理香则用更加大胆直接的方式表达爱意。这一集奠定了整个故事的基调——青春、恋爱、喜剧的完美融合。
第二话：三角关系的萌芽
随着剧情推进，圭太逐渐意识到两位姐姐对自己的感情并非普通的姐弟之情。亚香在圭太生病时的悉心照料，理香在体育祭上的热情应援，每一个场景都让观众感受到那份青涩而真挚的情感。
这一集中，「间接接吻」的名场面首次出现——亚香在圭太喝过的饮料上轻轻抿了一口，这个细微的动作让无数观众心跳加速，成为了亲吻姐姐最具代表性的场景之一。
第三话至第六话：感情的升温
中间几集通过校园生活、家庭日常等多个场景，深入刻画了三人之间微妙的情感变化。暑假合宿、学园祭、圣诞派对等经典校园事件轮番上演，每一个场景都为三人关系的发展提供了新的契机。
特别值得一提的是第五话中的「雨中相拥」场景，亚香在雨中为圭太送伞的温柔举动，以及理香随后冲入雨中表达不满的率真表现，将三角关系的张力推向了高潮。
最终话：未完成的答案
亲吻姐姐的最终话并没有给出明确的恋爱结局，而是选择了一个开放式的结尾。圭太意识到两位姐姐在他生命中不可替代的重要性，三人约定无论未来如何变化，都要一直在一起。这个结局引发了粉丝们的热烈讨论，也正是这种「未完待续」的感觉，让亲吻姐姐在粉丝心中留下了永恒的印记。